Der Schwerpunkt des Naturschutzgroßprojektes „Thüringer Rhönhutungen“ liegt im Erhalt der typischen Lebensräume der Vorderrhön. In den acht Kerngebieten sollen vorrangig Maßnahmen zum Erhalt der Lebensräume und Standorte der dort vorkommenden Pflanzen- und Tierarten durchgeführt werden. Zur Absicherung der Ziele und Maßnahmen soll durch die Berücksichtigung sozioökonomischer Belange ein nachhaltiges und zukunftsfähiges Landnutzungskonzept entwickelt werden.
Damit verbunden ist ein gewisses Maß an Realitätsbewusstsein und Kompromissbereitschaft, sowohl auf Seiten der Landnutzer als auch des Naturschutzes. Folgerichtig beschränkt sich das Leitbild nicht auf Idealzielvorstellungen des Naturschutzes oder „friert“ historische Zustände ein, sondern es integriert die aktuellen und gewünschten bzw. notwendigen Nutzungsformen.